Para texturizar um modelo 3D com atlas sem shaders complexos, use um modelo desempacotado UV e mapeie a textura do atlas para as suas coordenadas UV através de materiais básicos (como difuso ou BSDF Princípio) em software como Blender, Unity ou Maya.
Os atlas combinam várias texturas numa só, por isso só precisa de um material simples que ligue o atlas aos UVs do modelo. Não são necessários shaders em camadas ou procedurais.
Para iniciantes, experimente o BSDF Princípio padrão do Blender: conecte o seu atlas à entrada de Cor Base e, em seguida, ajuste o mapa UV se partes do atlas não estiverem alinhadas. É uma configuração simples que evita shaders complexos.