O modelo 3D do seu ativo Unity pisca durante a retopologia manual, principalmente devido a geometria sobreposta (z-fighting) ou normais de vértices incorretas.
Os rostos/bordas sobrepostos fazem com que o renderizador tenha dificuldades em priorizar as superfícies, causando cintilação. Normais invertidas ou inconsistentes perturbam o sombreamento da luz, também levando a cintilação.
Corrija isso usando a sua ferramenta de retopologia.