Para iniciantes, guardar um modelo 3D PLY envolve finalizar o seu modelo, usar Arquivo > Guardar Como/Exportar, selecionar o formato PLY, ajustar as definições básicas e escolher uma localização para guardar.
Finalize primeiro: Corrija erros simples.
Se você é novo no Blender, vá para Arquivo > Exportar > Stanford (.ply). É bastante simples. Comece com ASCII para praticar, depois mude para binário para modelos maiores assim que estiver confortável.