ブレンドシェイプの3Dモデルをアニメーション化するには、3Dソフトウェアで各ブレンドシェイプのウェイト値を時間に合わせて調整します。そうすることで、ベースメッシュがターゲットシェイプ（例えば、ニュートラルからスマイル）に移行していきます。
ブレンドシェイプは、ベースモデルとあらかじめ作成されたターゲットをマージするものです。そのため、アニメーションとは、各ターゲットが異なるフレームでベースにどれだけ影響を与えるかを設定することを意味します。
初心者の方は、Blenderを試してみてください。まず、シンプルなブレンドシェイプ（まばゆく見えたり、顔がしかったり）を追加し、Dope Sheetでウェイトキーフレームを設定すると、複雑なリグなしでタイミングスキルが身に付けられます。